市商務局是市政府工作部門，為正科級，掛市口岸辦公室牌子。
市商務局負責貫徹落實中央關于商務工作的方針政策和省委、南通市委、啟東市委的決策部署。在履行職責過程中，堅持和加強黨對商務工作的集中統(tǒng)一領導。主要職責是：
（一）貫徹執(zhí)行國家內(nèi)外貿(mào)易、國際經(jīng)濟合作和有關口岸工作的法律法規(guī)及方針政策，擬訂全市商務發(fā)展和實施規(guī)劃。監(jiān)測分析商務運行狀況，研究經(jīng)濟全球化、區(qū)域經(jīng)濟合作、現(xiàn)代流通方式、開放型經(jīng)濟新體制和流通體制改革并提出建議。
（二）擬訂全市內(nèi)貿(mào)發(fā)展規(guī)劃，促進城鄉(xiāng)商品市場發(fā)展。指導城鄉(xiāng)商業(yè)網(wǎng)點、商品交易市場（現(xiàn)貨交易類）規(guī)劃，推進城鄉(xiāng)商業(yè)體系建設，組織實施農(nóng)村現(xiàn)代流通網(wǎng)絡工程。
（三）負責推進流通產(chǎn)業(yè)結構調(diào)整，指導流通企業(yè)改革、商貿(mào)服務業(yè)發(fā)展，提出促進商貿(mào)中小企業(yè)發(fā)展的政策建議，推動流通標準化和連鎖經(jīng)營、商業(yè)特許經(jīng)營、物流配送等現(xiàn)代流通方式的發(fā)展。落實規(guī)范市場運行、流通秩序的政策。推動商務領域信用建設，指導商業(yè)信用銷售，建立市場誠信公共服務平臺。按有關規(guī)定對藥品流通等特殊流通行業(yè)進行監(jiān)督管理。
（四）承擔組織實施重要消費品市場調(diào)控和重要生產(chǎn)資料流通管理的責任。統(tǒng)計監(jiān)測分析市場運行和商品供求情況，進行預測預警和信息引導。負責建立健全生活必需品市場供應應急管理機制，按分工負責重要消費品儲備管理和市場調(diào)控工作。按有關規(guī)定對成品油流通進行監(jiān)督管理。統(tǒng)籌商務領域消費促進工作。
（五）負責擬訂口岸發(fā)展規(guī)劃并組織實施。負責口岸開放申報和建設工作。負責推進口岸功能平臺建設。負責協(xié)調(diào)推進全市電子口岸等口岸信息化建設與管理工作。負責口岸運行管理工作。負責推進口岸跨境貿(mào)易便利化建設。
（六）按規(guī)定負責全市國家級、省級開發(fā)區(qū)的指導、服務、協(xié)調(diào)和管理工作。擬訂并組織實施促進開發(fā)區(qū)建設發(fā)展的政策措施，編制全市開發(fā)區(qū)發(fā)展規(guī)劃草案，指導開發(fā)區(qū)編制建設規(guī)劃。研究分析開發(fā)區(qū)建設中的重大問題并提出建議意見。
（七）負責全市貨物進出口管理工作。擬訂發(fā)展規(guī)劃和政策措施，指導外貿(mào)工作和外貿(mào)體系建設。指導、推進跨境電子商務等外貿(mào)新業(yè)態(tài)新模式發(fā)展，推進出口品牌、出口基地和國際營銷網(wǎng)絡建設。負責重要工業(yè)品、原材料和農(nóng)產(chǎn)品進出口計劃、配額等申報工作，負責機電產(chǎn)品進出口、機電產(chǎn)品國際招標管理工作，執(zhí)行國家成套設備進出口政策。
（八）牽頭擬訂全市服務貿(mào)易發(fā)展規(guī)劃，指導服務貿(mào)易領域的對外開放。會同有關部門擬訂促進服務出口和服務外包發(fā)展的政策措施并組織實施，推動服務外包平臺建設。執(zhí)行國家對外技術貿(mào)易等政策，依法監(jiān)督全市技術引進、國家限制出口技術工作。
（九）貫徹執(zhí)行國家多（雙）邊（含區(qū)域、自由貿(mào)易試驗區(qū)）經(jīng)貿(mào)合作戰(zhàn)略和政策，參與處理國別（地區(qū)）經(jīng)貿(mào)關系中的有關事務。
（十）指導協(xié)調(diào)和管理全市外商投資工作，落實外商投資政策和改革方案。組織對外商投資企業(yè)設立及變更備案的監(jiān)督檢查。會同有關部門貫徹落實跨國公司地區(qū)總部和功能性機構鼓勵政策。牽頭推進外商投資重大項目，協(xié)調(diào)解決外商投資企業(yè)生產(chǎn)運行中的有關問題。
（十一）指導協(xié)調(diào)全市投資促進工作，擬訂全市投資促進工作計劃并組織實施。負責與其他國家（地區(qū)）政府經(jīng)濟部門、各類投資促進機構及國內(nèi)外知名企業(yè)的聯(lián)系。負責全市海外經(jīng)貿(mào)網(wǎng)絡的建設與管理。
（十二）負責全市對外投資和經(jīng)濟合作工作，擬訂和執(zhí)行促進對外投資合作的政策措施，管理和監(jiān)督對外投資、對外承包工程、對外勞務合作等。負責全市對外援助項目和接受多（雙）邊對我市的無償援助及贈款，推動構建對外投資合作促進和服務保障體系。
（十三）組織協(xié)調(diào)我市企業(yè)發(fā)起或應對反傾銷、反補貼、保障措施調(diào)查及其他與進出口公平貿(mào)易相關工作。建立進出口公平貿(mào)易預警機制，指導協(xié)調(diào)產(chǎn)業(yè)安全應對工作。執(zhí)行國家進出口管制政策，負責協(xié)調(diào)我國加入世界貿(mào)易組織后地方綜合性應對工作，參與公平競爭審查工作。規(guī)范對外貿(mào)易經(jīng)營秩序。
（十四）貫徹執(zhí)行國家有關自由貿(mào)易試驗區(qū)建設的方針、政策、法規(guī)和制度，牽頭復制推廣自由貿(mào)易試驗區(qū)經(jīng)驗。承擔全市海關特殊監(jiān)管區(qū)域和場所需要協(xié)調(diào)解決的有關工作。
（十五）研究全市電子商務發(fā)展的政策，會同有關部門擬訂全市電子商務發(fā)展規(guī)劃。推進全市商務系統(tǒng)信息化建設，落實商貿(mào)服務領域電子商務發(fā)展工作。
（十六）貫徹實施國家對香港、澳門特別行政區(qū)和臺灣地區(qū)的經(jīng)貿(mào)規(guī)劃、政策，指導我市對香港、澳門特別行政區(qū)及臺灣地區(qū)貿(mào)易工作，協(xié)調(diào)港、澳、臺商投資管理工作，組織對香港、澳門特別行政區(qū)和臺灣地區(qū)的經(jīng)濟交流與合作活動。
（十七）協(xié)調(diào)海關等部門與商務工作有關的事項。受市政府委托，指導、管理中國國際貿(mào)易促進委員會啟東市委員會（以下簡稱市貿(mào)促會）工作。
（十八）完成市委、市政府交辦的其他任務。
（十九）職能轉(zhuǎn)變。貫徹落實市委、市政府決策部署，進一步轉(zhuǎn)變職能，強化服務，簡政放權，放管結合，優(yōu)化營商環(huán)境，加強事中事后監(jiān)管，推進商務依法行政和法治化建設，推動商務高質(zhì)量發(fā)展。
（二十）與市市場監(jiān)督管理局的有關職責分工。市商務局負責貫徹執(zhí)行藥品流通發(fā)展規(guī)劃和政策，負責貫徹落實汽車銷售及其相關服務活動的規(guī)劃和政策，負責擬訂二手車流通行業(yè)發(fā)展的政策措施，牽頭負責報廢汽車回收拆解管理工作，負責擬訂成品油零售體系發(fā)展規(guī)劃。市市場監(jiān)督管理局在藥品監(jiān)督管理工作中，配合執(zhí)行藥品流通發(fā)展規(guī)劃和政策，配合做好藥品流通行業(yè)統(tǒng)計工作，負責依法查處汽車銷售、二手車交易管理中的違法違規(guī)行為，負責成品油市場質(zhì)量監(jiān)督管理，依法查處成品油市場違法違規(guī)行為。